醫(yī)院污水處理是指處理醫(yī)院排放的污水的處理方式。醫(yī)院的污水，除一般生活污水外，還含有化學物質(zhì)、放射性廢水和病原體。因此，經(jīng)過處理后才能排放，特別是肝炎等傳染病病房排出來的污水，須經(jīng)消毒后才可排放。無集中式污水處理設備的醫(yī)院，對有傳染性的糞便，單消毒使其無害化。常用消毒劑有二氧化氯、漂白粉、液氯、次氯酸鈉、臭氧。對含放射性同位素的污水，應按同位素處理要求處理。醫(yī)院污水在處理過程中，沉淀的污泥含有大量的細菌、病毒和寄生蟲卵，須經(jīng)消毒（常用熟石灰消毒）或高溫堆肥后方可用作肥料。

醫(yī)院污水處理過程中排出的污泥按每張病床計，每天平均為0.7～1升，含水95%，含有污水中病原體總量的70～80%，進行消毒處理。消毒方法有加熱消毒、化學藥劑消毒、γ射線消毒等。加熱消毒的熱源通常為蒸汽、電能或生物能（高溫堆肥），有的地區(qū)可以用太陽能。或者用焚燒法處理（見污泥焚燒）?；瘜W藥劑消毒可用漂白粉、石灰、氨水、液氯或苛性鈉等。用漂白粉或液氯時,有效氯用量約為污泥量的2.5%。用堿性藥劑時，污泥的pH值達到12后，保持半小時以上，效果好。γ射線消毒可用60鈷或一些裂變產(chǎn)物的混合物作輻射源，輻射劑量為20～30萬倫琴。用此法對污泥消毒不產(chǎn)生臭氣，并可改善污泥的脫水和沉降性，但費用較高。

根據(jù)國家環(huán)?？偩值挠嘘P(guān)規(guī)定（國家環(huán)?？偩?醫(yī)院污水處理技術(shù)指南.2003.12（環(huán)發(fā)（2003）197號 ），將各類醫(yī)院按性質(zhì)分為綜合醫(yī)院和傳染病醫(yī)院兩類，與衛(wèi)生系統(tǒng)對醫(yī)院及醫(yī)療機構(gòu)的劃分方法有差別。其中傳染病醫(yī)院指傳染性疾病?？漆t(yī)院和帶傳染病房的綜合醫(yī)院，綜合醫(yī)院為不帶傳染病房的綜合醫(yī)院和各類非傳染性疾病的?？漆t(yī)院。醫(yī)院污水凈化包括綜合醫(yī)院、中醫(yī)醫(yī)院、中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院、民族醫(yī)院和?？漆t(yī)院（傳染病醫(yī)院（包括結(jié)核病院）、心血管病醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院、口腔醫(yī)院、婦產(chǎn)科醫(yī)院和精神病醫(yī)院等等）各類醫(yī)院污水的處理，同時也包括療養(yǎng)院、康復醫(yī)院等其它醫(yī)療機構(gòu)和獸醫(yī)院的污水處理工程。