醫(yī)院各部門的功能、設(shè)施和人員組成情況不同，產(chǎn)生污水的主要部門和設(shè)施有：診療室、化驗室、病房、洗衣房、X光照像洗印、動物房、同位素治療診斷、手術(shù)室等排水。醫(yī)院行政管理和醫(yī)務(wù)人員排放的生活污水，食堂、單身宿舍、家屬宿舍排水。不同部門科室產(chǎn)生的污水成分和水量各不相同，如重金屬廢水、含油廢水、洗印廢水、放射性廢水等。而且不同性質(zhì)醫(yī)院產(chǎn)生的污水也有很大不同。醫(yī)院污水較一般生活污水排放情況復(fù)雜。

二氧化氯法：二氧化氯(ClO2)是一種強氧化劑，它在水中的溶解度是氯的5倍，其氧化能力是氯氣的215倍左右。它可以殺滅一切微生物，同時有效破壞水中的微量有機污染物，很好地氧化水中一些還原狀態(tài)的金屬離子。其大的優(yōu)點在于與腐殖質(zhì)及有機物反應(yīng)幾乎不產(chǎn)散性有機鹵化物，不生成并抑制生成有致癌作用的三鹵甲烷，也不與氨及氨基化合物反應(yīng)，因此非常適合用于醫(yī)院污水處理。

醫(yī)院排出的放射性廢水常用貯存衰減法處理。醫(yī)院常用的放射性同位素如131碘,32磷,198金，24鈉等是半衰期較短的同位素，因此可以將放射性污水貯存于地下衰變水池內(nèi),貯存時間為10倍于半衰期,把放射性濃度降到容許排放的程度。如果放射性污水的濃度很低，水量很小，也可用稀釋法處理。中國的《放射性防護規(guī)定》要求每一微居里放射性同位素達到容許排放濃度需稀釋水量1.67米3。當(dāng)放射性污水濃度很高,放射性的半衰期很長，不宜用貯存法和稀釋法處理時，可用蒸發(fā)法、離子交換法或凝聚沉淀法進行分離濃縮處理（見放射性廢水處理）。

醫(yī)院污水處理過程中排出的污泥按每張病床計，每天平均為0.7～1升，含水95%，含有污水中病原體總量的70～80%，進行消毒處理。消毒方法有加熱消毒、化學(xué)藥劑消毒、γ射線消毒等。加熱消毒的熱源通常為蒸汽、電能或生物能（高溫堆肥），有的地區(qū)可以用太陽能?；蛘哂梅贌ㄌ幚恚ㄒ娢勰喾贌??；瘜W(xué)藥劑消毒可用漂白粉、石灰、氨水、液氯或苛性鈉等。用漂白粉或液氯時,有效氯用量約為污泥量的2.5%。用堿性藥劑時，污泥的pH值達到12后，保持半小時以上，效果好。γ射線消毒可用60鈷或一些裂變產(chǎn)物的混合物作輻射源，輻射劑量為20～30萬倫琴。用此法對污泥消毒不產(chǎn)生臭氣，并可改善污泥的脫水和沉降性，但費用較高。

對于綜合醫(yī)院(不帶傳染病房)污水處理可采用“預(yù)處理→強化處理→消毒”的工藝。通過混凝沉淀(過濾)去除攜帶病毒、病菌的顆粒物，提高消毒效果并降低消毒劑的用量，從而避免消毒劑用量過大對環(huán)境產(chǎn)生的不良影響。 醫(yī)用污水處理的強化處理一般采用混凝沉淀、過濾、氣浮等工藝。過濾的固液分離方式需要反沖，操作管理較為復(fù)雜，而氣浮工藝中氣體釋放易導(dǎo)致二次污染。所以醫(yī)用污水中一般采用混凝沉淀工藝。

醫(yī)療廢水來自醫(yī)院，含有大量的病原細菌、病毒和化學(xué)藥劑，需要特殊工藝處理。醫(yī)療污水主要是從醫(yī)院的診療室、化驗室、病房、洗衣房、X片照相室和手術(shù)室等排放的污水，其污水來源及成分十分復(fù)雜。醫(yī)院污水中含有大量的病原細菌、病毒和化學(xué)藥劑，具有空間污染、急性傳染和潛伏性傳染的特征。