??化石是保存在巖石中的古生物遺體、遺物或遺跡，常見的是?骨頭和?貝殼等。?化石的形成過程涉及生物遺體或遺跡被埋藏在地層中，隨著時間的推移，遺體中的有機質分解，堅硬部分如骨骼、貝殼等與周圍沉積物一起石化，形成化石
《山海經》也有“石魚”（即魚化石）的記述；南朝齊梁時期陶弘景有對琥珀中古昆蟲的記述；宋朝沈括對螺蚌化石和杜綰對魚化石的起源，已有了正確認識。迄今，發(fā)現早的細菌化石為距今35億年前的澳大利亞瓦拉翁納群中的絲狀細菌化石。
煤系地層是生存于古生代時的植物的化石的主要來源。煤炭礦是采集化石好的場所，而且碳本身便是化石植物的殘留，雖然植物化石的結構細節(jié)很少會留在碳中。在蘇格蘭格拉斯哥維多利亞公園中的化石森林里，有發(fā)現鱗木的樹干。
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