通常，冷藏貨物可以分成兩種：冷藏和冷凍
許多冷藏貨物（例如水果）被視為是“活性（live）”貨物，因為其在采摘過后仍然能夠進行呼吸并且由于自熱、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他條件而容易腐爛。然而，其它商品比如冷藏肉/魚類和奶酪則并非如此。水果的低設(shè)定溫度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷凍貨物通常被認為是“惰性(inert)”貨物，一般在-18℃（0°F）或更低溫度下運載。既然冷藏和冷凍貨物都是易腐爛的，注意確保這類貨物以佳狀態(tài)交付。對于冷藏貨物，除了有限的幾種例外情況（比如肉，巧克力，膠片，化學(xué)物品，奶制品，人工氣調(diào)儲藏運輸貨物）外，其通風(fēng)設(shè)備通常要保持開啟狀態(tài)。一些貨物可能要求濕度控制或者大量的新鮮空氣（比如球莖花卉）。應(yīng)當(dāng)注意大多數(shù)冷凍裝置僅能夠減少濕度，并且這取決于所提供的新鮮空氣的數(shù)量。人工氣調(diào)儲藏運輸?shù)呢浳镄枰褂媚軌蚶玫投趸继娲鯕馑降挠猛镜募b箱，來延長已采摘的產(chǎn)品的保質(zhì)期。這種方法適用于許多有核和無核水果，但要求具備的知識來確定適宜的氣體濃度水平。

冷藏集裝箱脫離制冷時間：各種運輸方式之間的交接可能出現(xiàn)短途運輸或制冷系統(tǒng)故障，造成停止制冷。對冷凍和冷藏保鮮貨物短時間地停止制冷狀態(tài)是允許的。許多產(chǎn)品出現(xiàn)幾小時的停止制冷可以接受，但并非所有貨物都如此。對任何冷藏貨物均不允許出現(xiàn)長時間地停止制冷。對特種貨物和溫度靈敏貨物應(yīng)保持制冷系統(tǒng)連續(xù)工作，避免任何溫度波動造成貨物質(zhì)量下降。

裝貨前預(yù)冷過集裝箱，那么在打開柜門準備裝貨的時候，外界高溫度，濕度的空氣將會大量地進入柜內(nèi)與里面的低溫的空氣匯合，導(dǎo)致凝結(jié)大量的水珠在集裝箱內(nèi)壁上，這些水珠不僅會滴到貨物的外包裝上影響外包裝的美觀，而且會影響集裝箱制冷系統(tǒng)的運轉(zhuǎn)，對貨物品質(zhì)帶來不利影響。因為這些冷凝出來的水份由集裝箱制冷系統(tǒng)中的蒸發(fā)器來排除，而這些冷凝出來的水份經(jīng)過蒸發(fā)器盤管時就會結(jié)冰、這將使得制冷系統(tǒng)進行一次短暫的除霜過程。