農(nóng)業(yè)有機(jī)廢棄物包括農(nóng)業(yè)生產(chǎn)產(chǎn)生的各類農(nóng)作物秸稈，以及畜禽養(yǎng)殖產(chǎn)生的畜禽糞便等，處理難度較大，是環(huán)境治理的難題。將農(nóng)業(yè)有機(jī)廢棄物畜禽糞便、秸桿等作為可利用的資源進(jìn)行好氧發(fā)酵 ，不僅可以解決農(nóng)業(yè)生產(chǎn)廢物對(duì)環(huán)境的污染問(wèn)題，同時(shí)生產(chǎn)出來(lái)的有機(jī)肥可以帶來(lái)收益，實(shí)現(xiàn)了廢棄物的無(wú)害化、減量化、資源化，符合我國(guó)對(duì)環(huán)境保護(hù)和資源可持續(xù)利用的政策方針。

微生物代謝物有直接殺菌的作用且進(jìn)入土壤會(huì)在根際定殖，搶占生態(tài)位點(diǎn)讓線蟲及真無(wú)法侵染。有益微生物進(jìn)入土壤會(huì)在根系周圍產(chǎn)生大量粘多糖與植物分泌的粘液及礦物膠體、有機(jī)交替相結(jié)合，形成土壤團(tuán)粒結(jié)構(gòu)，提高土壤蓄肥、保水能。

生物菌肥是一種使用微生物菌群作為主要成分的有機(jī)肥料。它通過(guò)添加益生菌和有益微生物來(lái)改善土壤質(zhì)量和植物生長(zhǎng)環(huán)境。 生物菌肥中的微生物菌群包括一些對(duì)植物生長(zhǎng)有促進(jìn)作用的細(xì)菌和真菌，例如固氮菌、磷解菌和有機(jī)物分解菌等。這些微生物能夠與植物根系共生，提供植物所需的養(yǎng)分，促進(jìn)植物的生長(zhǎng)和發(fā)育。