由于無機物離子的直徑都很小（0.3～0.7nm），用普通的凝膠型樹脂是完全可以除去；但當水中有有機物分子存在時，由于其分子很大（膠硅化合物的粒徑可大于50nm，某些蛋白質(zhì)分子為5～20nm），用普通凝膠樹脂除去它們則有困難。而且再生時，這些被吸附的有機物也不易被再生下來，所以凝膠型樹脂易于被有機物所污染。

用普通合成法制成的離子交換樹脂，由許多不規(guī)則的網(wǎng)狀高分子組成，類似凝膠，所以稱其為凝膠型樹脂，如津南化工廠生產(chǎn)的001×7、201×7等都屬于凝膠型樹脂。凝膠型樹脂在水中會發(fā)生溶脹，體積變大，這種溶脹會使樹脂的機械強度降低；同時，當凝膠型樹脂在不同離子型態(tài)時，膨脹率也會發(fā)生變化。這樣就會因為樹脂的反復膨脹、收縮而使樹脂顆粒易于破碎。

樹脂在使用一段時間后，要進行再生處理，即用化學藥品使離子交換反應以相反方向進行，使樹脂的官能基團回復原來狀態(tài)，以供再次使用。如陽離子樹脂是用強酸進行再生處理，此時樹脂放出被吸附的陽離子，再與H+結(jié)合而恢復原來的組成。

在離子交換循環(huán)期間，將待處理的溶液加入離子交換樹脂床中并使其流過樹脂。當溶液移動通過離子交換樹脂時，樹脂的官能團吸引溶液中存在的任何抗衡離子。如果官能團對新抗衡離子的親和力大于已經(jīng)存在的那些離子，那么溶液中的離子將移除現(xiàn)有的離子并取代它們，通過共享的靜電吸引力與官能團結(jié)合。通常，離子的尺寸和/或價數(shù)越大，其與相反電荷的離子的親和力就越大。

鐵可以作為亞鐵或三價無機鹽或作為隔離的有機絡(luò)合物存在于水中。亞鐵在樹脂中交換，但三價鐵不溶，不會。三價鐵涂層陽離子樹脂，防止交換。使用酸或強還原劑來除去這種鐵。有機結(jié)合的鐵通過陽離子單元并污染陰離子樹脂。將其與有機材料一起除去。存在于某些井水中的錳以與鐵相同的方式污染樹脂。

鋁通常以氫氧化鋁形式存在，由鋁酸鈉或鋁酸鈉用于澄清或沉淀軟化。如果鋁絮狀物通過過濾器，則將樹脂涂在鈉沸石軟化劑中。用酸或苛性堿清洗即可將其除去。通常，鋁在脫礦質(zhì)系統(tǒng)中不是污垢，因為在正常再生期間鋁從樹脂中除去。