干燥場所應保持干燥，可通過安裝除濕設(shè)備將空氣濕度控制在較低水平，一般相對濕度宜控制在 40% - 60%。同時，在包裝前要對產(chǎn)品進行濕度檢測，確保其符合質(zhì)量標準。

干燥時間過短，產(chǎn)品水分含量過高，不利于儲存和運輸；干燥時間過長，不僅會增加能耗，還可能使卵磷脂過度干燥，導致產(chǎn)品質(zhì)地變脆、活性降低。例如，噴霧干燥的時間較短，通常在幾分鐘內(nèi)完成；而冷凍干燥則需要較長時間，可能持續(xù)數(shù)小時甚至數(shù)十小時。

溫度過高會導致卵磷脂氧化、變性，影響產(chǎn)品質(zhì)量，如使卵磷脂的活性成分喪失，降低其營養(yǎng)價值。一般來說，噴霧干燥的進風溫度通常控制在 150 - 200℃，出風溫度在 80 - 90℃；冷凍干燥時，預凍溫度需達到 - 40℃至 - 20℃，升華干燥階段溫度控制在 - 20℃至 20℃左右，解析干燥階段溫度可適當提高至 30 - 40℃。

環(huán)境濕度過高會使干燥后的卵磷脂重新吸收水分，導致產(chǎn)品含水量增加，影響儲存穩(wěn)定性，容易引起微生物滋生和產(chǎn)品變質(zhì)。
脫色：將經(jīng)過脫膠、脫酸處理的卵磷脂通過活性炭或活性白土等吸附劑進行脫色處理，去除其中的色素和其他雜質(zhì)，使卵磷脂的顏色變淺，提高產(chǎn)品的外觀質(zhì)量。
脫酸：采用堿煉法，向粗卵磷脂中加入適量的氫氧化鈉溶液，中和其中的游離脂肪酸，生成皂腳，再通過分離設(shè)備將皂腳去除，降低卵磷脂的酸值。